🧠 Huppert MCP - NIRS Toolbox Assistant

版本: v1.2
更新: 2026-01-27

NIRS-Toolbox 的 MCP (Model Context Protocol) 服务器，让 AI 助手能直接查阅 fNIRS 数据分析工具文档。

⚡ 快速开始

前置要求

Python 3.10+
Cursor IDE
NIRS-Toolbox 完整代码

安装步骤

# 1. 进入项目目录
cd huppert_mcp

# 2. 运行安装脚本
./setup.sh

# 会提示输入 NIRS-Toolbox 路径
# 自动完成：虚拟环境创建、依赖安装、配置生成

配置 Cursor

打开 ~/.cursor/mcp.json，添加生成的配置：

{
  "mcpServers": {
    "huppert": {
      "name": "Huppert Lab NIRS Toolbox",
      "command": "/完整路径/huppert_mcp/venv/bin/python3",
      "args": ["/完整路径/huppert_mcp/nirs_toolbox_mcp.py"],
      "env": {
        "NIRS_TOOLBOX_PATH": "/完整路径/nirs-toolbox"
      }
    }
  }
}

测试

1. Cmd+Q 退出 Cursor
2. 重新打开 Cursor
3. 输入: @huppert 详细介绍 BandPassFilter

🎯 主要功能

Resources（资源）

category:// - 列出所有模块类别
module:// - 查看特定模块详情
demo:// - 获取示例代码

Tools（工具）

search_module - 搜索模块
get_module_details ⭐ - 获取完整模块信息（属性、方法、示例）
find_workflow - 查找工作流推荐
compare_modules - 对比模块差异

Prompts（提示）

how_to_preprocess - 预处理指南
how_to_glm_analysis - GLM分析指南
how_to_load_data - 数据加载指南
build_pipeline - 构建流水线

💻 使用示例

基础查询

@huppert BandPassFilter
@huppert 有哪些滤波模块？

详细查询（推荐）

@huppert 详细介绍 AR_IRLS
@huppert 详细介绍 BeerLambertLaw

工作流推荐

@huppert 预处理的标准流程是什么？
@huppert 如何进行GLM分析？

模块对比

@huppert 对比 BandPassFilter 和 WaveletFilter

📚 文档

快速开始: START_HERE.md
用户指南: docs/USER_GUIDE.md ⭐
完整教程: docs/NIRS_MCP_完整指南.md
故障排查: docs/MCP问题诊断与解决.md
所有文档: docs/DOCS_INDEX.md

🐛 故障排查

问题：@huppert 未找到

# 1. 检查配置
cat ~/.cursor/mcp.json

# 2. 检查进程
ps aux | grep nirs_toolbox_mcp

# 3. 重启 Cursor
pkill -f "nirs_toolbox_mcp.py"
# Cmd+Q 退出，重新打开

问题：NIRS_TOOLBOX_PATH 未设置

在 ~/.cursor/mcp.json 中添加 env 字段：

"env": {
  "NIRS_TOOLBOX_PATH": "/你的路径/nirs-toolbox"
}

更多问题查看 docs/MCP问题诊断与解决.md

📦 项目结构

huppert_mcp/
├── nirs_toolbox_mcp.py       # MCP服务器主程序
├── setup.sh                  # 自动安装脚本
├── requirements.txt          # Python依赖
├── README.md                 # 项目说明
├── CHANGELOG.md              # 版本历史
├── LICENSE                   # MIT许可证
│
├── docs/                     # 文档目录
│   ├── USER_GUIDE.md         # 用户指南 ⭐
│   ├── NIRS_MCP_完整指南.md   # 完整教程
│   ├── NIRS_MCP_快速入门.md   # 快速入门
│   └── MCP问题诊断与解决.md   # 故障排查
│
└── tests/                    # 测试目录
    └── test_nirs_mcp.py

🔗 相关链接

NIRS-Toolbox: http://huppertlab.net/nirs-toolbox/
GitHub: https://github.com/huppertt/nirs-toolbox
MCP Protocol: https://modelcontextprotocol.io/
Huppert Lab: http://huppertlab.net/

📝 许可证

MIT License - 详见 LICENSE 文件

本项目提供 NIRS-Toolbox 的 MCP 接口，NIRS-Toolbox 本身有其独立的许可证。

🙏 致谢

Theodore J. Huppert 教授 - NIRS-Toolbox 创始人
Huppert Lab - 工具箱开发团队
MCP 社区 - 协议开发者

让 fNIRS 数据分析更简单！ 🚀

作者: Liam
版本: v1.2
更新: 2026-01-27

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